Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Higd1bQ99JY6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms