Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lims1Q99JW4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms