Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Spef1Q99JL1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spef1Q99JL1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms