Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms