Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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