Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms