Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lmo1Q924W9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms