Protein–RNA interactions for Protein: Q923S9

Rab30, Ras-related protein Rab-30, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab30Q923S9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab30Q923S9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab30Q923S9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab30Q923S9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab30Q923S9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms