Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms