Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pde6cQ91ZQ1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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