Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms