Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hps3Q91VB4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps3Q91VB4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms