Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc12Q8R344 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms