Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms