Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Mrpl47Q8K2Y7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mrpl47Q8K2Y7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mrpl47Q8K2Y7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mrpl47Q8K2Y7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mrpl47Q8K2Y7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mrpl47Q8K2Y7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mrpl47Q8K2Y7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Mrpl47Q8K2Y7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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