Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Trappc12Q8K2L8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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