Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms