Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim68Q8K243 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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