Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

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Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbc1d23Q8K0F1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbc1d23Q8K0F1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbc1d23Q8K0F1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbc1d23Q8K0F1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbc1d23Q8K0F1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbc1d23Q8K0F1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbc1d23Q8K0F1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbc1d23Q8K0F1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbc1d23Q8K0F1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbc1d23Q8K0F1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbc1d23Q8K0F1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbc1d23Q8K0F1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tbc1d23Q8K0F1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tbc1d23Q8K0F1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Tbc1d23Q8K0F1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Tbc1d23Q8K0F1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Tbc1d23Q8K0F1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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Tbc1d23Q8K0F1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbc1d23Q8K0F1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms