Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FgbQ8K0E8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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FgbQ8K0E8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FgbQ8K0E8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FgbQ8K0E8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FgbQ8K0E8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FgbQ8K0E8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FgbQ8K0E8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FgbQ8K0E8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FgbQ8K0E8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FgbQ8K0E8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FgbQ8K0E8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FgbQ8K0E8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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