Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SbsnQ8CIT9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SbsnQ8CIT9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms