Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI15

Sphk1, Sphingosine kinase 1, mousemouse

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk1Q8CI15 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sphk1Q8CI15 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sphk1Q8CI15 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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