Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip3Q8CHD8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms