Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ercc8Q8CFD5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ercc8Q8CFD5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ercc8Q8CFD5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ercc8Q8CFD5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ercc8Q8CFD5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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