Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms