Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atad2Q8CDM1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atad2Q8CDM1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms