Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8CC96 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8CC96 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Q8CC96 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8CC96 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms