Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb2Q8CC27 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb2Q8CC27 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms