Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd4aQ8CBY1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms