Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm16223Q8CBM3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms