Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms