Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5P7

Tdrp, Testis development-related protein, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrpQ8C5P7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdrpQ8C5P7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms