Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rapgef5Q8C0Q9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rapgef5Q8C0Q9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rapgef5Q8C0Q9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rapgef5Q8C0Q9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rapgef5Q8C0Q9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rapgef5Q8C0Q9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rapgef5Q8C0Q9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rapgef5Q8C0Q9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rapgef5Q8C0Q9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rapgef5Q8C0Q9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rapgef5Q8C0Q9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rapgef5Q8C0Q9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rapgef5Q8C0Q9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rapgef5Q8C0Q9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms