Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trim35Q8C006 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trim35Q8C006 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trim35Q8C006 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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