Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms