Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Usp38Q8BW70 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Usp38Q8BW70 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Usp38Q8BW70 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Usp38Q8BW70 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Usp38Q8BW70 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Usp38Q8BW70 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Usp38Q8BW70 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Usp38Q8BW70 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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