Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms