Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum3Q8BKS9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms