Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smarcal1Q8BJL0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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