Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms