Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Htatsf1Q8BGC0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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