Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim65Q8BFW4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms