Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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