Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms