Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Amigo1Q80ZD8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Amigo1Q80ZD8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Amigo1Q80ZD8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Amigo1Q80ZD8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Amigo1Q80ZD8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Amigo1Q80ZD8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Amigo1Q80ZD8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Amigo1Q80ZD8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Amigo1Q80ZD8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Amigo1Q80ZD8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Amigo1Q80ZD8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Amigo1Q80ZD8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Amigo1Q80ZD8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Amigo1Q80ZD8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Amigo1Q80ZD8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Amigo1Q80ZD8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Amigo1Q80ZD8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Amigo1Q80ZD8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Amigo1Q80ZD8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Amigo1Q80ZD8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Amigo1Q80ZD8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Amigo1Q80ZD8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Amigo1Q80ZD8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Amigo1Q80ZD8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Amigo1Q80ZD8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Amigo1Q80ZD8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Amigo1Q80ZD8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Amigo1Q80ZD8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Amigo1Q80ZD8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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