Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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