Protein–RNA interactions for Protein: Q80UN9

Trit1, tRNA dimethylallyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trit1Q80UN9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trit1Q80UN9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms