Protein–RNA interactions for Protein: Q80SY5

Prpf38b, Pre-mRNA-splicing factor 38B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38bQ80SY5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf38bQ80SY5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf38bQ80SY5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf38bQ80SY5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf38bQ80SY5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf38bQ80SY5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf38bQ80SY5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf38bQ80SY5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf38bQ80SY5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf38bQ80SY5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf38bQ80SY5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf38bQ80SY5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf38bQ80SY5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf38bQ80SY5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf38bQ80SY5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf38bQ80SY5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf38bQ80SY5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms