Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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