Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms